樹番茄直接生食、榨汁飲用、制成果醬或搭配其他食材烹飪食用效果較好。樹番茄富含維生素C、膳食纖維和多種礦物質，適當食用有助于補充營養(yǎng)、促進消化。

樹番茄生食能夠最大程度保留其天然營養(yǎng)成分，果肉酸甜多汁，維生素C不易受熱破壞。選擇外皮橙紅、質地稍軟的成熟果實，洗凈后剝?nèi)ケ∑ぜ纯墒秤?，果肉中的果膠和有機酸有助于刺激胃液分泌。榨汁時搭配適量溫水，每日飲用不超過200毫升，樹番茄汁含有豐富鉀元素和抗氧化物。制作果醬可將樹番茄去皮后與冰糖慢火熬煮，過程中維生素C會有部分流失，但糖分滲透能改善口感，適合涂抹面包或作為甜品配料。樹番茄與肉類同燉能軟化肉質，其含有的果酸可分解蛋白質，與海鮮快炒則能去腥提鮮。樹番茄酸奶沙拉將果肉切塊后拌入酸奶，冷藏后食用，乳酸菌與膳食纖維共同調(diào)節(jié)腸道菌群。

食用樹番茄需注意徹底清洗表皮，腸胃功能較弱者應避免空腹食用過多。樹番茄果核較多，幼兒及吞咽困難者需去核后食用。對番茄科植物過敏的人群首次嘗試應小劑量測試，出現(xiàn)皮疹或胃腸不適立即停止食用。樹番茄不宜與高鈣食物大量同食，其中草酸可能影響鈣質吸收，建議間隔兩小時以上食用。日常儲存時未成熟樹番茄可常溫放置，成熟后需冷藏并盡快食用，冷凍保存會破壞果肉細胞結構影響口感。